Illumina voorafgemaakte biblioteke
Kenmerke
●Platforms:Illumina NovaSeq 6000 en NovaSeq X Plus
●Volgorde-modusse:PE150 en PE250
●Gehaltebeheer van biblioteke voor volgordebepaling
●Opeenvolging van data QC en aflewering:aflewering van QC-verslag en rou data in fastq-formaat na demultipleksing en filtering van Q30-lesings
Diensvoordele
●Veelsydigheid van volgordebepalingdienste:die kliënt kan kies om volgens baan, vloeisel of volgens hoeveelheid data wat benodig word (gedeeltelike baanvolgorde) te volgorde.
●Uitgebreide ervaring op Illumina-volgordeplatform:met duisende geslote projekte met verskeie spesies.
●Lewering van volgorde QC-verslag:met kwaliteit statistieke, data akkuraatheid en algehele prestasie van die volgordebepaling projek.
●Volwasse volgordebepaling proses:met kort omkeertyd.
●Streng kwaliteitbeheer: ons implementeer streng QC-vereistes om die lewering van konsekwent hoë kwaliteit resultate te waarborg.
Voorbeeld platforms
| Platform | Vloeisel | Volgorde-modus | Eenheid | Geskatte uitset |
| NovaSeq X | 10B (8 bane) | PE150 | Enkelbaan Gedeeltelike baan | 375 Gb / baan |
| 25B (8 bane) | PE150 | Enkelbaan Gedeeltelike baan | 1000 Gb/baan | |
| NovaSeq 6000 | SP Flow sel (2 bane) | PE250 | Vloeisel Enkelbaan Gedeeltelike baan | 325-400 M lees / Baan |
| S4 vloeisel (4 bane) | PE150 | Vloeisel Enkelbaan Gedeeltelike baan | ~800 Gb / baan |
Voorbeeldvereistes
| Databedrag (X) | Konsentrasie (qPCR/nM) | Volume | |
| Gedeeltelike baanvolgorde
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Laanvolgorde | Per Lane | ≥ 1,5 nM / Biblioteekpoel | ≥ 25 μl / Biblioteek swembad |
Benewens konsentrasie en totale hoeveelheid, word 'n geskikte piekpatroon ook vereis.
Let wel: Laan-volgordebepaling van biblioteke met 'n lae diversiteit vereis PhiX-spit-in om robuuste basisoproepe te verseker.
Ons beveel aan dat vooraf saamgevoegde biblioteke as voorbeelde ingedien word. As jy BMKGENE benodig om biblioteekpoel uit te voer, verwys asseblief na
die biblioteekvereistes vir gedeeltelike baanvolgordebepaling.
Biblioteekgrootte (Piekkaart)
Hoofpiek moet binne 300-450 bp wees.
Biblioteke moet 'n enkele hoofpiek hê, geen adapter kontaminasie en geen primer dimers nie.
Kontak ons asseblief as u monsters nie aan die beginmateriaalvereistes voldoen nie.
Dienswerkvloei
Biblioteek kwaliteit beheer
Opeenvolging
Data kwaliteit beheer
Projek aflewering
Biblioteek QC verslag
'n Verslag oor die kwaliteit van die biblioteek word verskaf voor opeenvolging, assessering van biblioteekhoeveelheid en fragmentering.
Volgorde QC verslag
Tabel 1. Statistiek oor volgordebepalingsdata.
| Voorbeeld ID | BMKID | Rou lees | Rou data (bp) | Skoon lees (%) | Q20(%) | V30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figuur 1. Kwaliteitverspreiding langs leesstukke in elke monster
Figuur 2. Basisinhoudverspreiding
Figuur 3. Verspreiding van leesinhoud in volgordebepalingdata
